バイオマーカージャーナル オープンアクセス

抽象的な

肺がん患者および環境汚染にさらされた高リスク者の血清中の循環遊離 DNA とゲノム変化

マルタ A、カロリーナ T、ウリセス U、ライオネル G、ホセ D、マルコ C、モニカ C、アルシデス Z、ヒューゴ B、ペドロ M、ベロニカ RM

早期発見技術と予後バイオマーカーの導入は、特にPAHやヒ素などの環境発がん物質に高度にさらされている都市では必須です。この研究では、LCおよびPNL患者のcfDNAレベルを評価し、血清cfDNA中のCNAを決定することを提案しました。この研究では、中程度または高いLCリスクを持つメトロポリタン地域(N = 51)とアントファガスタ地域(N = 56)の合計107人を登録しました。cfDNAは、Qiagen QIAamp DNAミニキットを使用して血清アリコートから分離されました。cfDNAのHMM分析は、未知の配列を決定し、反復するDNA増加と減少の最小共通領域(MCR)を定義するための確率モデルとして使用されました。この研究では、cfDNAレベルはLCの悪性化中に増加しましたが、前癌病変または浸潤前段階では有意に増加しなかったことが示されています。 cfDNA は、LC の予後と進行を高精度に予測する補完ツールとして使用できます (特異度 87.3%、PNV 76.4%)。さらに、cfDNA には肺腫瘍形成プロセスに関連する染色体異常がいくつか含まれており、LC が疑われる症例の確認に使用できます。これらの変化の中には、炎症反応 (SERPING1)、体液性免疫反応 (IGCK)、自然免疫と上皮の完全性 (CTNN1)、腫瘍抑制因子 (MAP2K4、DMTF1、ABCB4)、酸化ストレスへの反応 (COX10) に関連する遺伝子を含む特定の染色体断片の喪失が示唆されています。結論として、cfDNA のこれらのバイオマーカーは、LC のリスクが高い集団のスクリーニング方法として大きな可能性を秘めている可能性があります。

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