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抽象的な

XNA技術を用いた大腸がんの早期発見

マイケル・J・パウエル

DiaCarta の科学者は、液体生検および FFPE サンプルにおける腫瘍遺伝子変異およびその他の重要な遺伝子変異の感度ニーズに対応するために、革新的な異種核酸分子クランプ技術 (XNA 技術) を開発しました。XNA 技術は、ワトソン-クリック塩基対合により対象のターゲット DNA 配列をハイブリダイズする、独自に設計された XNA オリゴマーと修正されたバックボーンを使用します。配列が完全に一致する場合、XNA は DNA ターゲット配列にしっかりとハイブリダイズし、PCR 反応で DNA ポリメラーゼによる鎖伸長をブロックします。ただし、ターゲット配列に変異が存在する場合、ミスマッチによって XNA オリゴマー:DNA 二重鎖が不安定になり、DNA ポリメラーゼによる鎖伸長が可能になります。その結果、変異を含むターゲット配列のみが増幅対象として選択され、野生型配列は、DNA の量/コピーがはるかに多いにもかかわらず、増幅されません。XNA オリゴマーは DNA ポリメラーゼによって認識されないため、その後のリアルタイム PCR 反応でプライマーとして使用することはできません。 XNA 分子クランプ アッセイは、液体生検または腫瘍組織生検 (FFPE) サンプルから得られた核酸を使用して、非常に感度の高いアッセイです。検出限界 (LOD) は、患者の血液 2 ml にほぼ相当する 5 ng の ctDNA で 0.5% (変異 DNA のコピー 7 または 8) まで低下します。循環する無細胞変異腫瘍 DNA (ctDNA) およびエクソソーム由来の核酸のレベルが高いと、大腸がんやその他のがんの生存率が低下することがわかっており、そのレベルの動的モニタリングは、がん治療の予測因子として使用できます。